Выполнение проекта по теме: «Разработка технологий ранней диагностики клещевого энцефалита, основанных на изменениях экспрессии генов и продукции белков в инфицированных антиген-презентирующих клетках»

Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича» (ИБМХ), совместно с Биологическим центром Чешской академии наук выполняет проект в рамках реализации федеральной целевой программы «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2014 — 2020 годы» по теме: «Разработка технологий ранней диагностики клещевого энцефалита, основанных на изменениях экспрессии генов и продукции белков в инфицированных антиген-презентирующих клетках», Соглашение о предоставлении субсидии №14.616.21.0094 от 12.02.2018 г. с Минобрнауки России, уникальный идентификатор работ (проекта) RFMEFI61618X0094.

На первом этапе ИБМХ им. В.Н. Ореховича выполнены следующие работы:

  • Проведён аналитический обзор современной научно-технической, нормативной, методической литературы, затрагивающей научно-техническую проблему, исследуемую в рамках проекта.
  • Выполнена сравнительная оценка вариантов решения проблемы и обоснование выбора оптимального варианта направления выполнения проекта.
  • Проведены патентные исследования в соответствии c ГОСТ Р 15.011-96.
  • Выбраны и наработаны модельные клетки для протеомных исследований.
  • Экспериментально разработан протокол пробоподготовки для протеомных исследований.
  • Разработан протокол протеомного исследования модельных клеток.
  • Исследован протеомный профиль модельных клеток.
  • Проведена корректировка протокола протеомного исследования модельных клеток по результатам исследования протеомного профиля.

Иностранным партнером проведены следующие работы:

  • Выделены антигенпрезентирующие клеток из крови лабораторных животных.
  • Выполнена структурно-функциональная характеристика выделенных клеток.
  • Осуществлена пробоподготовка антигенпрезентирующих клеток для транскриптомных исследований.
  • Экспериментально отработан протокол транскриптомного исследования антигенпрезентирующих клеток: исследован транскриптомный профиль антигенпрезентирующих клеток, выделенных из крови лабораторных животных.

На втором этапе ИБМХ им. В.Н. Ореховича выполнены следующие работы:

  • Проведена пробоподготовка экспериментальных образцов, полученных из моноцитов крови, инфицированных вирусом клещевого энцефалита к проведению протеомного исследования.
  • Исследован протеомный профиль моноцитов крови, инфицированных вирусом клещевого энцефалита.
  • Проведена пробоподготовка экспериментальных образцов, полученных из антигенпрезентирующих клеток крови, инфицированных вирусом клещевого энцефалита к проведению протеомного исследования.
  • Исследован протеомный профиль антигенпрезентирующих клеток, инфицированных вирусом клещевого энцефалита.

Иностранным партнером проведены следующие работы:

  • Выполнено инфицирование моноцитов крови вирусом клещевого энцефалита для проведения транскриптомных и протеомных исследований.
  • Произведена наработка и передача экспериментальных образцов, полученных из инфицированных моноцитов крови, соисполнителю со стороны Российской Федерации для проведения протеомных исследований.
  • Исследован транскриптомный профиль моноцитов крови, инфицированных вирусом клещевого энцефалита.
  • Выполнено инфицирование антигенпрезентирующих клеток вирусом клещевого энцефалита для проведения транскриптомных и протеомных исследований.
  • Произведена наработка и передача экспериментальных образцов, полученных из инфицированных антигенпрезентирующих клеток, соисполнителю со стороны Российской Федерации для проведения протеомных исследований.
  • Исследован транскриптомный профиль антигенпрезентирующих клеток, инфицированных вирусом клещевого энцефалита

На третьем этапе ИБМХ им. В.Н. Ореховича выполнены следующие работы:

  • верифицированы результаты протеомных исследований в серии биологических повторов;
  • разработана спецификация белковых маркеров для ранней диагностики клещевого энцефалита;
  • проведена экспериментальная оценка перспективы использования выявленных белковых маркеров для скрининга эффективности кандидатных фармакологических средств: пробоподготовка и проведение протеомных исследований антигенпрезентирующих клеток;
  • проведена технико-экономическая оценка результатов проведения исследований;
  • проведены дополнительные патентные исследования патентоспособности полученных результатов;
  • выполнено обобщение результатов выполнения проекта, проверено их соответствие требованиям ТЗ, оценена результативность проекта и эффективности результатов в сравнении с современным научно-техническим уровнем.

Иностранным партнером проведены следующие работы:

  • разработана спецификация РНК-маркеров для ранней диагностики клещевого энцефалита;
  • верифицированы результаты транскриптомных исследований;
  • выполнено обобщение и оценка полученных результатов.

Индустриальным партнером проведены следующие работы:

  • выполнена экспериментальная оценка перспективы использования выявленных белковых маркеров для скрининга эффективности фармакологических кандидатных средств: наработаны модельные антигенпрезентирующих клеток (далее — контрольные клетки); наработана партия фармакологического кандидатного средства (далее — ЛП) на основе окисленных декстранов; проведена обработка модельных клеток ЛП; осуществлена передача контрольных клеток и клеток, обработанных ЛП, головному исполнителю;
  • сформированы предложения по внедрению результатов проведения исследований на базе индустриального партнера.